Les molècules de polímer de cautxú de silicona són estructures semblants a la cadena formades per enllaços SI-O (silici-oxigen), i el seu component principal és el polisiloxà lineal de massa molar elevada. Com que l’enllaç Si-O-Si és el seu tipus d’enllaç bàsic, els àtoms de silici estan connectats principalment a grups de metil i s’introdueixen una quantitat molt petita de grups insaturats a les cadenes laterals.
Les forces intermoleculars són petites i les molècules tenen una estructura helicoïdal. Els grups de metil estan disposats cap a fora i poden girar lliurement, cosa que fa que el cautxú de silicona tingui una millor resistència a la calor, aïllament elèctric, estabilitat química, etc. que altres gomes comunes.
El cautxú típic de silicona, és a dir, el polidiformaldehid siloxà, té una configuració molecular helicoïdal amb forces intermoleculars relativament petites, que posseeixen una excel·lent resiliència. Mentrestant, els grups formaldehid que apunten fora de l’hèlix poden girar lliurement, cosa que dóna a la cautxú de silicona amb propietats de superfície úniques com la hidrofobicitat i la no-enganxament de la superfície